外気の侵入、埃や微生物の移動による汚染の拡散を防ぐために、各部屋は各々固有の室圧にコントロールをされています。
管理室では各部屋の環境や機器の状態がコンピューター制御により24時間体制で監視・記録されています。
細胞培養担当者は最初に管理室より一次更衣室(第1清浄区域)を通って、準備室(第2清浄区域)に入ります。そこから、二次更衣室(第3清浄区域)を通って、細胞調製室に入室します。
細胞培養調製室から退室する場合は、脱衣室を通ります。各部屋にはエアロックが設けられ、ドアはオートロックにより一方通行にしか行き来できません。